日式旅馆的住宿费用由一宿带两餐的基本费用加上10—15%的服务费构成。而且要征收5%的消费税。另外，在云仙温泉还需另外支付一人150日元的泡温泉税。
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通常，客人在预约的时候，需告知到达的时间。若预知到要迟到的话，需尽早通知旅馆人员。当客人没有告知到达时间，那么一般的惯例是在晚餐（下午六时）前到达。在旅馆的住宿须知里规定，在一般情况下，若房客事先不打招呼并在住宿的当天晚上八点（若事先有告知预计到达时间的话，则从该到达时间算起两个小时之后的时刻）仍未到达，则视作退房。当客人在途中遇到交通堵塞，如可预测到要迟到的话，应告知旅馆何时才能到达，或者是现在在某个位置，不能如期到达。只要客人能够把情况告知对当地道路熟悉的旅馆工作人员，那到达时间就能预知。此方法最为稳妥。
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对于家族旅行或者是四到五人的小旅行团，通常有送至客房的送餐服务。这些服务是当地旅馆和酒店的一项基本服务形式。但如果是团体旅行的话，那么在绝大多数情况下都要求客人到宴会厅或是餐厅用餐。晚餐时间通常是下午五时到八时。当遇到特殊情况时，稳妥的做法是在到达时将自己所希望用餐的时间告诉给旅馆工作人员。关于食物的种类，有材料或风格都是有季节感的日式正餐，另外还可以品尝到独具云仙风味的多种菜肴。还可以应客人要求烹制活鱼或火锅，可现吃现做，并能品尝到地方菜（需另付款）。（若客人希望能品尝到某些特殊菜肴时，需在用餐的前一天或尽可能在预约时说好）
近来，客人很多时候在饭堂（宴会厅、餐厅）用早餐，菜谱开列的基本上是日式，但开列西式的旅馆现在慢慢多了起来。在一些规模较大的酒店里，以自助餐方式进行的也不少见。
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在旅馆里备有浴衣以供客人休息时穿用。不仅在旅馆内穿用可以，穿着上街也无妨。还可以当睡袍穿。天气冷的时候，可在浴衣外面穿上一件叫半天的日式外衣或长袖衣服。
衣领不分男女，一般都是左领在前面。
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